最高指挥机关--德国航空部(Reichluftfahrtministerium-RLM),具有两个功能：
第一为德国空军最高司令部(Oberkommando der Luftwaffe-OKL) ，全德国空军直接受其指挥。OKL 又为几个分支部门，主要掌管：1。作战行动；2。组织；3。训练；4。活动；5。情报；6。装备；7。不详；8。不详；9。人员；第 1，3，5 项由作战行动总参谋长负责；第 2，4，6，9 项由军需总监(Generalquartiermeister)负责。
第二为 国家航空部(Reichsminister der Luftfahrt)，主要管理行政事务，长期规划管理，财政，民间航空活动和飞机生产(直到 1944 年为止)。帝国元帅赫尔曼。戈林兼任德国航空部部长(Reichsminister der Luftfahrt)和德国空军总司令(Luftfahrt and Oberbefehlshaber der Luftwaffe), 德国空军最高司令部(Oberkommando der Luftwaffe-OKL)--分为前方部门和后方部门。前方部门：代号 Robinson，包括总参谋长，作战行动参谋长，通信总监，训练总监和部份情报部门，这个部门位于国防军最高统帅部(Oberbefehlshaber der Wehrmacht)；后方部门：代号 Kurfürst, 包括了最高司令部的其它部门，其位于柏林和附近一带。这两个部门之间由专门联络官和通信设备保持联系。
通常每天都有 2 个会议讨论和汇报德国空军的计划，建议和所作的决策。最重要的是中午会议---在希特勒的元首大本营内举行。主要由最高参谋长向元首汇报战况和德国空军所计划的决策。
航空队 Luftflotten(LF)：为最大的前线作战单位，下辖数个航空军，航空师，航空团，大队和独立部队。主要负责整个地区的空中作战和对陆军的支援。最初有 4 个航空队，而后来随着德国地面部队的推进，又成立了 3 个新的航空队。以阿拉伯数字编号，例如 Luftflotte 1。指挥官为上将(Generaloberst)或者更高。
共有：第 1，2，3，4，5，6，和“帝国”(Reich)航空队以及一些临时混编的航空队。
作战区域：
1939 年书院 第 1 航空队--德国东北部 第 2 航空队--德国西北部 第 3 航空队--德国西南部 第 4 航空队--德国东南部
1942 年 bbs 东部航空队(Luftflotte Ost 由第 1 航空队，第 5 航空军和顿河飞行队 Luftwaffe Kdo. Don 混编而成)--苏联中部 第 2 航空队--北非，意大利和希腊 第 3 航空队--法国，荷兰和比利时 第 4 航空队--苏联南部 第 5 航空队--挪威和芬兰书院, 中部指挥官航空队(Luftwaffe befehlshaber Mitte)--德国 1944 年 第 1 航空队--波罗的海 第 2 航空队--意大利北部第 3 航空队--法国，荷兰和比利时战 第 4 航空队--匈牙利，南斯拉夫，罗马尼亚和保加利亚 第 5 航空队--挪威和芬兰 第 6 航空队--苏联中部帝国航空队--德国 1945 年 第 1 航空队--利陶宛 第 2 航空队--意大利北部 第 3 航空队--德国西部和荷兰 第 4 航空队--匈牙利和南斯拉夫 第 5 航空队--挪威和芬兰 第 6 航空队--东普鲁士 帝国航空队--德国中部
其以第 1 航空队(Luftflotte 1)1943 年 5 月编制为例，下辖: 第 22 侦察大队-Aufkl 鋜 ungsgruppe 22 第 122 侦察大队-Aufkl 鋜 ungsgruppe 122 第 54 战斗航空团-Jagdgeschwader 54
第 53 轰炸航空团-Kampfgeschwader 53 夜间侦察大队-Nachtaufkl 鋜 ungsgruppe K&}|`)B 第 8 侦察大队-Nahaufkl 鋜 ungsgruppe 8 第 11 侦察大队-Nahaufkl 鋜 ungsgruppe 11 第 127 海上侦察大队-Seeaufkl 鋜 ungsgruppe 127 第 5 俯冲轰炸航空团-Sturtzkampfgeschwader 5 第 1 航空军指挥中队-St 鰎 kampfstaffeln Luftflotte 1
航空军 Fliegerkorps(FG)---由数个航空师以及空降师组成。拥有作战飞机大约300-700 架。以罗马数字编号，例如 I Fliegerkorps，共有：第 1，2，4，5，8，9，10，11，12，13，14 和“突尼斯”(Fliegerkorps Tunis)航空军 其中以第 10 航空军(X Fliegerkorps)1941 年 6 月编制为例：
第 14 侦察大队-Aufkl 鋜 ungsgruppe 14 第 121 侦察大队-Aufkl 鋜 ungsgruppe 121 第 122 侦察大队-Aufkl 鋜 ungsgruppe 122 第 123 侦察大队-Aufkl 鋜 ungsgruppe 123D 第 27 战斗航空团-Jagdgeschwader 27 第 26 轰炸航空团-Kampfgeschwader 26 第 30 轰炸航空团-Kampfgeschwader 30 fC
cn 第 1 特别轰炸航空团-Kampfgeschwader zbV 1 文 第 172 特别轰炸航空团-Kampfgeschwader zbV 172bbs 第 9 特别轰炸大队-Kampfgruppe zbV 9;fAZ5g 第 506 海岸飞行大队-Küstenfliegergruppe 506 第 1 训练航空团-Lehrgeschwader 1 第 126 海上侦察大队-Seeaufkl 鋜 ungsgruppe 126 第 1 俯冲轰炸航空团-Sturzkampfgeschwader 1
第 3 俯冲轰炸航空团-Sturzkampfgeschwader 3 第 26 驱逐大队-Zerst 鰎 ergeschwader 26 除了以上 12 个航空军还有 2 个战斗军 (Jagdkorps)：第 1 和第 2 战斗军 航空师 Flieger-Division (FD)：指挥 1 个或者更多的航空团，以阿拉伯数字编号。共有：第 1，2，3，4，5，6，7，9，10，14，15，16，17，18，道尼滋(Flieger-Division Donetz)航空师 除了航空师以外，还有其他类型的师部队：
战斗师(Jagddivision)。共有：
第 1，2，3，4，5，7，8 和 30 战斗师 训练航空师(Flieger-Ausbildungs-Divisionen)，共有：第 1 和第 2 航空训练师 航校师(Flieger-Schul-Divisionen)，共有：第 1，2，3，4 航校师 1 个空军教导师(Luftwaffen-Lehrdivision)，1 个航空目标师(Flieger-Ziel-Division) 以上都是战略行政编制 航空团 Geschwader：也叫联队，最大的战术编制，一般下辖团本部和 3-4 个大队，第 4 大队通常为训练大队(Erganzungsgruppe)，而在 1941 年开始有的航空团第 4 大队也也为正式作战部队。
团本部拥有作战飞机 4 架左右，每个大队拥有作战飞机 40 架左右。
全团作战飞机在战争初期约为 112架，战争中期约为 164架，战争末期约为276架(这只是理论情况)。
团指挥官(Geschwaderkommodore 或 Kommodore )通常为少校，他的参谋人员一般包括一名副官，一名作战行动军官，一名情报军官，一名导航军官，一名技术军官，一名通信军官和其它的特殊技术军官。以阿拉伯数字编号。根据类型不同可分为：
战斗航空团 Jagdgeschwader(JG)主要装备 120-125 架单引擎战斗机。共有：第 1“余绍”(Oesau)，2“里希特霍芬”(Richthofen)，3“乌德特”(Udet),4,5“北冰洋”(Eismeer)，6“霍斯特。维瑟尔”(Horst Wessel)，7“诺沃提尼”(Nowotny)，11，20，21，26“施拉格特”(Schlageter)，27，28，50，51"莫德斯"(M 鰈 ders)，52，53“黑桃”(Pik As)，54“绿心”(Grünherz)，70，71，72，76，77“红桃”(Herz As)，101，102，103，104，105，106，107，108，109，110，111，112，113，117，300“野猪”(Wilde sau)，301，302，400 和特别航空团(Jagdgeschwader z.b.V.) .
轰炸航空团 Kampfgeschwader(KG)装备 80-90 架轰炸机。共有：第 1“海登堡”(Hindenburg)，2“铁锤”(Holzhammer),3“闪电”(Blitz),4“维福将军”(General Wever),6,25,26“狮子”(L 鰓 en),27“布尔科”(Boelcke),28,30“老鹰”(Adler),40,50,51,53“ 秃 鹰 军 团 ” (Legion Condor),54 “ 骷 髅 ” (Totenkopf),55 “ 狮 头 鹰 ”(Greif),60,66,76,77,100,101,102,200 轰炸航空团。
0{9X6u3y2}+u 特别轰炸航空团 Kampfgeschwader zbV(KG zbv )装备运输机。共有：第 1，2，4，5，9，172 特别轰炸航空团 训练航空团 Lehrgeschwader (LG)主要装备轰炸机，以及少量战斗机。共有：第 1，2训练航空团 书 夜间战斗航空团 Nachtjagdgeschwader(NG)装备夜间战斗机。共有：第 1，2，3，4夜间战斗航空团 对地攻击航空团 Schlachtgeschwader(SG)装备战斗轰炸机和攻击机。共有：第 1，2对地攻击航空团 快速轰炸航空团 Schnellkampfgeschwader(SKG)装备双引擎战斗机。共有：第 10，210快速轰炸航空团 俯冲轰炸航空团 Sturzkampfgeschwader(STG)装备俯冲轰炸机。共有：第 1，2“殷麦曼”(Immelmann)，3，5，51，76，77，101。102，151 俯冲轰炸航空团 0f 驱逐航空团 Zerst 鰎 ergeschwader(ZG)装备双引擎战斗机。共有：第 1，2，26，52，76，101 驱逐航空团 大队 Gruppen(Gr)：德国空军最主要的战术编制，一般部队的调动都是以大队为基本单位，下辖一个大队本部和 3-4 个中队。
大队本部拥有作战飞机 3-4 架，总共大约 40 架飞机和 500 名人员，通常一个完整的大队拥有一个独立的机场。
大队长(Gruppenkommandeu 或 Kommandeur)级别不定(一般战斗机大队为少校而轰炸机大队为上尉)他的参谋人员包括一名副官，一名特别技术军官和一名卫生军官。以罗马数字编号，例如 II/JG52 即为第 52 战斗航空团第 2 大队，依此类推。另外除了各航空团下属大队之外，还有一些独立的大队：
侦察大队 Aufkl 鋜 ungsgruppen(Aufk.Gr)装备侦察机。共有：第 10，11，12，13，14，
21，22，23，，31，32，33，41，120，121，122，123，124 和德国空军指挥部侦察大队(Aufkl 鋜 ungsgruppe der Oberkommando der Luftwaffe) 轰炸大队 Kampfgruppen (K.Gr)装备轰炸机。共有：第 100，106，126，606，806 轰炸大队 特殊轰炸大队 Kampfgruppen zbV(K.Gr zbv)装备运输机。共有：第 9，50，102，104，105，106，108，400，500，600，700，800，900 特殊轰炸大队 海岸飞行大队 Küstenfliegergruppen(Küst.Gr)装备水上飞机。共有：第 106，406，506，606，706，906 海上飞行大队文 搜索大队 Nahaufkl 鋜 ungsgruppen(N.Aufk.Gr)装备侦察机。共有：第 1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16 搜索大队 海上侦察大队 Seeaufkl 鋜 ungsgruppen(See.Aufk.Gr)装备水上侦察机。共有：第 125，126，127 海上侦察大队 另外还有第 196 船基航空大队 Bordfliegergruppe 196 (装备 Ar196 水上飞机)和第 196舰载大队 Tr 鋑 ergruppe 186--这个大队装备了 Bf 109 和 Ju 87 ，原本计划装备德国海军航空母舰“格拉夫.齐伯林”号(Graf Zeppelin)，但是该舰始终没有完工。
中队 Staffel (St) ：下辖 3-4 个“四机编队”或者 6-8 个“双机编队”，或在俯冲轰炸机部队中则为 4-5 个“三机编队”。通常装备 12-16 架飞机，人员为 20-25 名飞行员和 160 名地勤人员，双引擎部队则为 80 名地勤人员，中队长(Staffelkapit 鋘)或临时中队长(Staffelführer)从中尉到上尉不等。以阿拉伯数字编号，例如: 1.II/KG77 既为第 77 轰炸航空团第 2 大队第 1 中队。bbs.cqzg.cnc8n3Q-? v8X
四机编队 Schwarm：德国空军最基本的作战单位，由 2 个“双机编队”组成，通常由先头“双机编队”飞在另一个“双机编队”的侧前方不远(四指战术)，编队由经验丰富的飞行员领头，不分军衔级别。四机编队指挥官(Schwarmfuehrer)级别不定。
三机编队 Kette：这种编队只在俯冲轰炸机部队中。
双机编队 Rotte：德国空军中最小的作战单位，由长机(Rottenfuehrer) 和僚机机飞行员(Rottenflieger 或者 Katchmarek)组成.
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